南通农业职业技术学院园林园艺系是该校下设的二级院系，前身为1995年设立的园艺教研室，2003年9月正式建系。现设有园艺技术（院级重点专业）、园林技术、园林工程技术等专业，2024年新增都市园艺专业，培养都市农业复合型技术人才。师资团队包含专任教师19人，其中副高职称占比40%、硕博学历占比64%、双师型教师占比92%，拥有省级实训中心、20个实训室及24个校外实践基地。
该系自1995年起开设园林园艺类专业，累计培养毕业生近千人。依托工学结合与“多证制”培养模式，构建覆盖园艺生产、景观设计等领域的实践教学体系。2014年后围绕长三角城市一体化与江苏沿海开发战略，深化产学研合作，目标建成省级示范性高职院校特色专业群 。行政机构设园林与园艺教研室，配备党群组织系统 。
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