第三只眼睛是位于人类大脑丘脑上部的松果腺体，外文名pineal body，长约5～8mm，重120～200mg。该结构被认为是生物进化中退化的感光器官，希腊古生物学家奥尔维茨通过研究大穿山甲头骨发现退化眼眶，证实脊椎动物普遍存在第三眼结构。
十七世纪笛卡尔提出松果腺体为灵魂载体，现代研究显示其是分泌血清素及褪黑激素的内分泌腺体，通过调节睡眠周期、体温变化等生理活动控制性腺、肾上腺等腺体功能。松果腺体通过眼睛接收光信号，其褪黑激素分泌量与光照强度成反比。该腺体组织中含有钙、镁、磷、铁等晶体颗粒构成的“脑砂”，15岁后随年龄增长逐渐累积，但未影响腺体功能 。
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